Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NifkQ91VE6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NifkQ91VE6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms