Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Capn8Q91VA3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms