Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ApofQ91V80 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms