Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rhbdd2Q8VEK2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Rhbdd2Q8VEK2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rhbdd2Q8VEK2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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