Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smg8Q8VE18 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smg8Q8VE18 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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