Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Med17Q8VCD5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Med17Q8VCD5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms