Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nae1Q8VBW6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nae1Q8VBW6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms