Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4F0

Mcoln3, Mucolipin-3, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln3Q8R4F0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Mcoln3Q8R4F0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mcoln3Q8R4F0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mcoln3Q8R4F0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mcoln3Q8R4F0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Mcoln3Q8R4F0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Mcoln3Q8R4F0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Mcoln3Q8R4F0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Mcoln3Q8R4F0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Mcoln3Q8R4F0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcoln3Q8R4F0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms