Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc12Q8R344 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc12Q8R344 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms