Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Vmn1r200Q8R281 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r200Q8R281 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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