Protein–RNA interactions for Protein: Q8R191

Syngr3, Synaptogyrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr3Q8R191 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syngr3Q8R191 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms