Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Vrk3Q8K3G5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Vrk3Q8K3G5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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