Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3F2

Mmp21, Matrix metalloproteinase-21, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp21Q8K3F2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp21Q8K3F2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp21Q8K3F2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms