Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc47a1Q8K0H1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc47a1Q8K0H1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms