Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfm1Q8K0D5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gfm1Q8K0D5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfm1Q8K0D5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms