Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Lrit1Q8K099 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Lrit1Q8K099 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Lrit1Q8K099 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Lrit1Q8K099 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms