Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pnma3Q8JZW8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pnma3Q8JZW8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms