Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf628Q8CJ78 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf628Q8CJ78 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms