Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TwnkQ8CIW5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TwnkQ8CIW5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms