Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NgefQ8CHT1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NgefQ8CHT1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms