Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Rab11fip3Q8CHD8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Rab11fip3Q8CHD8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Rab11fip3Q8CHD8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Rab11fip3Q8CHD8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Rab11fip3Q8CHD8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Rab11fip3Q8CHD8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Rab11fip3Q8CHD8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Rab11fip3Q8CHD8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Rab11fip3Q8CHD8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Rab11fip3Q8CHD8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Rab11fip3Q8CHD8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Rab11fip3Q8CHD8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Rab11fip3Q8CHD8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab11fip3Q8CHD8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip3Q8CHD8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms