Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGK6

Ifnl3, Interferon lambda-3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnl3Q8CGK6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifnl3Q8CGK6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms