Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ercc8Q8CFD5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ercc8Q8CFD5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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