Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snx8Q8CFD4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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