Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Usp27Q8CEG8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Usp27Q8CEG8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Usp27Q8CEG8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Usp27Q8CEG8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Usp27Q8CEG8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Usp27Q8CEG8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Usp27Q8CEG8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Usp27Q8CEG8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp27Q8CEG8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms