Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc63Q8CDV6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc63Q8CDV6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms