Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc73Q8CDM4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc73Q8CDM4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms