Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lrif1Q8CDD9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Lrif1Q8CDD9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Lrif1Q8CDD9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Lrif1Q8CDD9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Lrif1Q8CDD9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Lrif1Q8CDD9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrif1Q8CDD9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrif1Q8CDD9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrif1Q8CDD9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrif1Q8CDD9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrif1Q8CDD9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms