Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nsun3Q8CCT7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nsun3Q8CCT7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms