Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynpoQ8CC35 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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