Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
4930507D05RikQ8C9C9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms