Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

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Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Col6a6Q8C6K9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Col6a6Q8C6K9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Col6a6Q8C6K9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Col6a6Q8C6K9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Col6a6Q8C6K9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Col6a6Q8C6K9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Col6a6Q8C6K9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Col6a6Q8C6K9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Col6a6Q8C6K9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col6a6Q8C6K9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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