Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bhlhe22Q8C6A8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms