Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sfrp1Q8C4U3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sfrp1Q8C4U3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms