Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc90bQ8C3X2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms