Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ssuh2Q8C3L1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssuh2Q8C3L1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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