Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

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Length 725 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc2Q8BZW8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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