Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tnfsfm13Q8BXS2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tnfsfm13Q8BXS2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tnfsfm13Q8BXS2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Tnfsfm13Q8BXS2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsfm13Q8BXS2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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