Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Iffo1Q8BXL9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Iffo1Q8BXL9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Iffo1Q8BXL9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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Iffo1Q8BXL9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Iffo1Q8BXL9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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