Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldn17Q8BXA6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn17Q8BXA6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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