Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Vps13cQ8BX70 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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