Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp5Q8BX09 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms