Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW22

Ss18l1, Calcium-responsive transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l1Q8BW22 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ss18l1Q8BW22 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ss18l1Q8BW22 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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