Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nup54Q8BTS4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup54Q8BTS4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms