Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ppfia2Q8BSS9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ppfia2Q8BSS9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms