Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI4

Gen1, Flap endonuclease GEN homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gen1Q8BMI4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gen1Q8BMI4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gen1Q8BMI4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms