Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik4Q8BMF5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms