Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c2Q8BL74 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c2Q8BL74 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c2Q8BL74 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gtf3c2Q8BL74 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf3c2Q8BL74 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms