Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gpc2Q8BKV1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gpc2Q8BKV1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms