Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJW5

Nol11, Nucleolar protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol11Q8BJW5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nol11Q8BJW5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nol11Q8BJW5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms